Квантово-механический/молекулярно-механический анализ механизмов действия ферментов [Текст] / С. В. Лущекина [и др.] // Известия РАН. Серия химическая. - 2011. - № 11. - С. 2154-2162 : 6 рис. - Библиогр.: с. 2161-2162 (38 назв. ) . - ISSN 0002-3353
Рубрики: Биология Общая биохимия Кл.слова (ненормированные): механизм реакции -- ацетилхолин -- метод КМ/ММ -- метод квантовой механики/молекулярной механики -- квантовая подсистема -- теория функционала плотности -- функционалы ВВ1К -- функционалы B3LYP -- силовое поле AMBER -- ацетилхолинэстераза Аннотация: При моделировании комбинированным методом квантовой механики/молекулярной механики (КМ/ММ) реакции гидролиза ацетилхолина в активном центре аиетилхо- линэстеразы исследовано влияние разделения системы на КМ- и ММ-части. Выделен минимальный состав молекулярной подсистемы, относимой к КМ-части, который необходим для адекватных расчетов энергетических профилей элементарных стадий реакций ферментативного катализа. Сопоставлены полученные энергетические профили и оценены погрешности при расчетах методом КМ/ММ. Показана высокая стабильность тетраэдрического интермедиата стадии ацилирования, что хорошо согласуется с недавними экспериментальными результатами. Доп.точки доступа: Лущекина, С. В.; Калиман, И. А.; Григоренко, Б. Л.; Немухин, А. В.; Варфоломеев, С. Д. Имеются экземпляры в отделах: всего 1 : ч.з. (1) Свободны: ч.з. (1) |